Genialny, chiński generał z epoki Trzech Królestw odradza się we współczesnej Japonii. Choć jest to dla niego okazja, by w końcu zaznać spokojnego życia, ten postanawia nie zdradzić swojego taktycznego talentu i rusza, by podbić przemysł muzyczny Tokyo.

Boruto rozpoczyna swoją drogę ninja, chcąc wydostać się z cienia ojca i zdobyć nowe umiejętności oraz przyjaciół.

Na drodze głównych bohaterów pojawia się nowy wróg, którego celem jest zniszczenie świata astralnego i ocalenie tym samym własnego.

Naruto wraca do Konohy, by dotrzymać słowa złożonego Sakurze i uwolnić Sasuke z rąk Orochimaru.