W roku 2029 świat jest połączony gęstą elektroniczną siecią, która rządzi każdym aspektem ludzkiego życia. Ta sama sieć staje się polem bitwy dla Sekcji Dziewiątej tokijskich sił bezpieczeństwa, która ma doprowadzić do aresztowania mistrza hakerów znanego jedynie jako Władca Marionetek.
Lilo i Stich są wstrząśnięci, gdy Dr Hämsterviel ucieka z więzienia i zmusza Jumbę do zbudowania Leroya - złego sobowtóra Sticha. Co gorsza, Hämsterviel wkrótce klonuje to paskudne małe stworzenie, aby zbudować własną szelmowską armię.