Batman wraz ze swoimi sojusznikami i przeciwnikami przenosi się do feudalnej Japonii. Aby oprzeć się złu, Mroczny Rycerz zostaje mścicielem ninja.

Po wydarzeniach w poprzednich częściach, Afro stał się najgroźniejszym wojownikiem na ziemi. Jednak wybrał życie w odosobnieniu. Wszystko się zmienia gdy u jego drzwi zjawia się mściwa Lady Sio, wraz ze swoim gangiem rządnych zemsty maniaków. Kobieta zabiera mu opaskę Nr 1 oraz resztki czaszki jego zmarłego ojca. Chcąc zapewnić ojcu spokojny spoczynek, Afro po raz kolejny  zmuszony jest wkroczyć na ścieżkę przemocy. Wyrusza na poszukiwania opaski Nr 2, która da mu prawo walki o szczątki swego ojca.