Gdy Ash wraz z przyjaciółmi przystępuje do walki w rozgrywkach w Eindoak Town, spotyka tam mitycznego Pokemona Victini, który zostaje ich nowym przyjacielem. Nadciąga jednak katastrofa - fałszywy wędrowiec Damon przechwytuje Victini do swoich własnych planów! Czy Ash udowodni, że jest bohaterem i zyska pomoc legendarnego Zekroma, żeby uratować Victini i całe miasto Eindoak?

ZOROARK UWALNIA SWÓJ GNIEW! Daje się wyczuć działanie tajemniczych mocy, gdy ASH i jego przyjaciele udają się w podróż  do Crown City na Mistrzostwa Świata Pokemonów – Pokemon Baccer World Cup! Kiedy pewnego dnia do miasta przybywa trójka legendarnych Pokemonów RAIKOU, ENTEI i SUICUNE rozpoczyna się chaos i spustoszenie. Wszystko teraz jest w rękach ASHA, jego kompanów i nowego przyjacielskiego Pokemona ZORUA, którzy muszą poznać sekret i pokonać ogromną i potężną siłę. Co tak dziwnego i strasznego rozgrywa się w Crown City? Czemu nagle po dwudziestu latach nieobecności powraca CELEBI? I czemu mocarny ZOROARK uwalnia swój gniew nad Crown City?  Czy ASH i jego drużyna odnajdą w sobie wystarczająco siły i odwagi aby rozwikłać tę zagadkę? Czy ich przyjaźń przetrwa i pozwoli OCALIĆ CROWN CITY?

Gdy Odwrócony Świat ogarnia ciemność, Giratina wpada we wściekłość i prowokuje Dialgę do walki, przypadkowo wciągając Shaymina do Odwróconego Świata. Shayminowi udaje się uciec do Świata Pokemonów, gdzie wraz z Ashem i jego przyjaciółmi kontynuuje podróż. Gdy czarny charakter Zero grozi, że przejmie władzę, Giratina, Ash i Shaymin wspólnie stają z nim do walki w ekscytującym finale!

Zły i podstępny Kapitan Phantom chce być w posiadaniu pewnego jaja, z którego wkrótce wykluje się legendarny pokemon zwany Księciem Mórz - Manafi. Kiedy jajo trafia w ręce niegodziwca, młody Jackie - Strażnik Pokemon, wykrada niewyklutego stworka. Tymczasem Ash, May, Brock i Max wciąż kontynuują swoją wędrówkę, aż pewnego dnia spotykają pana Walkera u którego przebywa Jackie z jajkiem. Wiedzą oni, że wkrótce Kapitan Phantom przybędzie po jajko. Ash postanawia pomóc im i nienarodzonemu pokemonowi.

Ash wraz z przyjaciółmi znajduje się w środku konfliktu pomiędzy Deoxysem a Rayquazem.