Badania nad bronią jądrową sprawiają, że Godzilla budzi się ze snu, czyniąc zniszczenie w Tokio. Potwór nie jest jedynym zmartwieniem Japończyków, gdyż wojną grozi Związek Radziecki.

Mothra podejmuje się walki z Godzillą, która sieje zniszczenie w Tokio.

Zuchwały mężczyzna porywa kobiety z wyspy Infant, które wysyłają telepatycznie wołanie o pomoc do Mothry. Szukając niewiast, wielka ćma sieje terror i zniszczenie w Tokio.

Tokio zostaje zaatakowane przez potwory. Kluczem do unicestwienia bestii jest znaleziona książka, która wyjaśnia proces ich ewolucji.