Gdy Atsushiego Nakajimę wyrzucono z sierocińca, został bez jedzenia i dachu nad głową. Przypadkowo ratuje człowieka o nazwisku Dazai, który w nagrodę wciela go do tajnej agencji.
Rodzice Thora i Raia zostają zamordowani, a oni sami zesłani na obcą planetę. W nowym otoczeniu chłopcy toczą walkę o przetrwanie, wierząc, że kiedyś powrócą do domu.
Shin'ichi jest uważany za współczesnego Sherlocka Holmesa. Podczas jednego ze swoich śledztw zostaje otruty, jednak trucizna zamiast zabić, zamienia go w dziecko.