Gdy Atsushiego Nakajimę wyrzucono z sierocińca, został bez jedzenia i dachu nad głową. Przypadkowo ratuje człowieka o nazwisku Dazai, który w nagrodę wciela go do tajnej agencji.

Shin'ichi jest uważany za współczesnego Sherlocka Holmesa. Podczas jednego ze swoich śledztw zostaje otruty, jednak trucizna zamiast zabić, zamienia go w dziecko.