W odległej przyszłości zdominowanej przez przełom ludzi dysponujących supermocami, Yuito Sumeragi dołącza do specjalnej grupy zadaniowej, aby walczyć z rosnącym zagrożeniem i tajemniczością.

Głównym bohaterem, jest Allen Walker, szarowłosy chłopak, który przez swój wygląd wyraźnie rzuca się w oczy. Jednak nie bez powodu, gdyż Allen jest egzorcystą , osobą posiadającą Innocence, niezwykłą broń przeciw akumom. Co to akuma? Otóż, jest to straszliwa broń, maszyna z przytwierdzoną do niej ludzką duszą. Stwory te są tworzone przez niejakiego Milenijnego Earla. Allen wraz z grupą egzorcystów musi, powstrzymać akumy, gdyż potrafią one tylko zabijać. Co będzie dalej? Czy Allenowi i innym posiadaczom Innocence uda się powstrzymać Earla?

Łowcy głów poszukują sprawcy ataku terrorystycznego, za którego wyznaczono wysoką nagrodę.

Onizuka, szef gangu motocyklowego, podejmuje pracę w liceum, pragnąc zostać najlepszym nauczycielem wszech czasów.

W nieodległej przyszłości na Ziemi zabrakło miejsca dla wszystkich ludzi, część z nich musiała opuścić rodzinną planetę i zamieszkać w koloniach - wielkich statkach - państwach. Hiro Yui jednoczy kolonie i stara się wywalczyć ich niepodległość, jednak ginie w zamachu. Po pewnym czasie na ziemi ląduje pięć tajemniczych maszyn, które niszczą ważne strategicznie obiekty wojskowe - jeden z pilotów nosi ponoć nazywa się Hiro Yui...