Toorop w ciągu sześciu dni ma przemycić za granicę przesyłkę, którą jest dziewczyna o unikalnych zdolnościach.

Fabularnie "Dzieci Diuny" łączy w sobie wątki z drugiego i trzeciego tomu cyklu: "Mesjasza Diuny" i "Dzieci Diuny". Tematem filmu jest walka Paula Atrydy z zakonem Bene Gesserit, który nie potrafi kontrolować Muad'Diba, a także wydarzenia, które miały miejsce po odejściu Paula na pustynię, kiedy rozpoczęła się Ekologiczna Transformacja Diuny, a na Arrakis pojawił się tajemniczy starzec zwany Kaznodzieją.

Zbiegły kryminalista postanawia zmienić swoje życie. Gdy zostaje burmistrzem, w mieście pojawia się inspektor policji, który próbuje go zdemaskować.