Leonardo, Donatello, Raphael i Michelangelo to cztery zmutowane żółwie, wyszkolone w sztukach walk przez mistrza Splintera. Wspólnie strzegą miasta Nowy Jork.
Rok po śmierci Eric Draven powraca jako anioł zemsty, by pomścić morderstwo swoje oraz ukochanej Shelly. W misji towarzyszy mu czarny kruk, który jest łącznikiem ze światem żywych.