Na skutek tajemniczego rozbłysku światła cała ludzkość zostaje zamieniona w kamień. Po trwającej kilka tysięcy lat petryfikacji Taiju oraz jego genialny przyjaciel Senku wybudzają się i przystępują do odbudowy zniszczonej cywilizacji.

16-letnia Shizuku Mizutani jest jedną z najlepszych uczennic w szkole, a jej świat kręci się wyłącznie wokół nauki. Pewnego dnia zostaje oddelegowana przez jedną z nauczycielek, by dostarczyć materiały z lekcji Haru Yoshidzie. Chłopak, znany ze swojej porywczości, już pierwszego dnia szkoły wdał się w bójkę, przez co został tymczasowo zawieszony. Boją się go zarówno uczniowie, jak i nauczyciele i nikt nie ma odwagi przekonać go do powrotu. Ku zaskoczeniu wszystkich, wizyta Shizuku sprawia, że Haru zmienia zdanie i postanawia wrócić do szkoły. Dziewczynę zaś, ku jej niezadowoleniu, uznaje za swoją nową przyjaciółkę i od tej pory nie odstępuje jej na krok.