Niegdyś przeklęta przez wiedźmę, uwięziona w ludzkiej formie Guideau przemierza świat, szukając winowajcy. Towarzyszy jej elegancki mag Ashaf, wysłannik tajemniczej organizacji.
Nieśmiała Natsu po przebudzeniu dowiaduje się, że należy do grupy wybrańców, którzy mają zapewnić ciągłość rasy ludzkiej. Razem muszą przetrwać na odmienionej Ziemi.
Jedyna córka zamordowanego króla rozpoczyna poszukiwania reinkarnacji czterech legendarnych smoków, chcąc by zostali jej sprzymierzeńcami w walce o odzyskanie tronu.
W poprzedniej serii Echizen Ryoma wraz z drużyną Seigaku postawili sobie za cel zdobycie mistrzostwa Japonii. Nim udało im się spełnić to marzenie musieli sprostać wielu trudnościom. Zarówno Echizen jak i jego koledzy musieli także rozwijać swoje umiejętności, aby podołać kolejnym, coraz silniejszym przeciwnikom. Gdy udaje im się wreszcie osiągnąć cel i Seigaku zdobywa upragniony tytuł mistrza, Ryoma opuszcza Japonię i wraca do Stanów, aby wziąć udział w mistrzostwach US Open. Po niedługim czasie otrzymuje zaproszenie, aby wraz z 50-tką innych zdolnych gimnazjalistów dołączyć do japońskiego obozu treningowego U-17 (Under Seventeen – Poniżej 17-tu lat). Obóz znany jest z tego, że kształci najlepszych tenisistów. Jest to pierwszy raz, gdy zaproszenie otrzymują uczniowie gimnazjum. Najlepszym drużynom i graczom znanym z poprzedniej serii przyjdzie się teraz zmierzyć z licealistami. Z początku nie oczekują oni zbyt wiele po starszych kolegach. Wkrótce jednak przyjdzie im stawić czoło graczom, których poziom znacznie przewyższa ten znany im do tej pory.
Oz Vessalius jest dziedzicem jednego z czterech Rodów Szlacheckich, które kontrolują kraj. W dniu swych piętnastych urodzin, w trakcie ceremonii symbolizującej wkroczenie w dorosłe życie, z nieznanych przyczyn zostaje zaatakowany przez wyklęty klan Baskerville i odesłany do legendarnego więzienia - Abyss. Ucieczkę umożliwia mu zawarcie kontraktu z łańcuchem (org. 'chain') Alice, znaną jako B-Rabbit. Mimowolnie Oz zostaje wplątany w niezrozumiałą dla siebie wojnę między Pandorą a Baskerville'ami...
Takashi otrzymuje w spadku po babce Księgę Przyjaciół zawierającą spis pokonanych przez nią duchów. Chłopiec postanawia zwrócić właścicielom ich imiona.
Nastoletni Lelouch otrzymuje moc zwaną Geass, dzięki której wymusza posłuszeństwo na każdym, kto spojrzy mu w oczy. Chłopak postanawia wykorzystać dar, by zniszczyć obecne imperium i stworzyć nowy, lepszy świat.
Głównym bohaterem, jest Allen Walker, szarowłosy chłopak, który przez swój wygląd wyraźnie rzuca się w oczy. Jednak nie bez powodu, gdyż Allen jest egzorcystą , osobą posiadającą Innocence, niezwykłą broń przeciw akumom. Co to akuma? Otóż, jest to straszliwa broń, maszyna z przytwierdzoną do niej ludzką duszą. Stwory te są tworzone przez niejakiego Milenijnego Earla. Allen wraz z grupą egzorcystów musi, powstrzymać akumy, gdyż potrafią one tylko zabijać. Co będzie dalej? Czy Allenowi i innym posiadaczom Innocence uda się powstrzymać Earla?
Pomiędzy Unią, a Deague toczy się wieloletnia wojna międzygwiezdna. Ralph to wyjątkowo zdolny pilot mecha typu Strain walczący po stronie Unii, którego umiejętności są stawiane za wzór kandydatom na nowych pilotów. Młodsza siostra Ralpha, 16-letnia Sara pragnie zostać pilotem i przyłączyć się do walki u boku brata. Pewnego dnia Deague atakuje obóz treningowy Sary, a na czele napastników stoi nie kto inny jak sam Ralph. Sara postanawia za wszelką cenę odnaleźć brata i dowiedzieć się dlaczego zdradził Unię i przyłączył się do wroga.
Lata 20. XX wieku. Rosette - jedna ze sióstr z zakonu Magdalenek zostaje wyćwiczona jako egzorcysta i ratuje miasta USA przed niszczycielskim działaniem demonów. Towarzyszy jej inny demon Chrono który zobowiązał się pomagać swojej partnerce dopóki ta nie odzyska brata porwanego przez Aiona - jednego z najpotężniejszych demonów.