Kiedy pojawia się nowy wróg, zastępczy żniwiarz dusz Ichigo Kurosaki wraca na pole bitwy z mieczem zanpakutō, aby pomóc potrzebującym.

Młoda dziewczyna wyrusza w świat, aby nauczyć się samodzielności. Podczas wędrówki poznaje Alzeido, chłopaka o magicznych umiejętnościach.

W bliżej nieokreślonej przyszłości, wszyscy noszą okulary które nakładają na świat rzeczywisty jego odbicie w cyberprzestrzeni, również umożliwiają wykonywanie telefonów i obsługę programów przy pomocy prostych ruchów ręką. W mieście Daikoku, cyberprzestrzeń zachowuje się inaczej niż gdziekolwiek indziej, dochodzi tu do dziwnych wypadków, właścicielom giną ich "cyber zwierzaki", a w cyberprzestrzeni miasta znajduje się dużo niezbadanych obszarów. Zagadkami cyberprzestrzeni Daikoku zajmuje się organizacja detektywistyczna Coil, złożona z dzieci, które wydają się lepiej niż dorośli zauważać tajemnice otaczającej ich cyberprzestrzeni.

Nastolatek Ichigo Kurosaki, posiadający zdolność widzenia duchów, otrzymuje moce boga śmierci-Shinigami od Rukii Kuchiki i wyrusza, aby ocalić świat przed Pustymi.

Onizuka, szef gangu motocyklowego, podejmuje pracę w liceum, pragnąc zostać najlepszym nauczycielem wszech czasów.