Serial jest kolejną częścią przygód Gintokiego Sakaty i jego przyjaciół. Gintoki to weteran walk z Amanto - kosmitami którzy najechali na naszą planetę. Teraz gdy czasy się zmieniły samurajowie są jedynie reliktem przeszłości. Aby związać koniec z końcem ten srebrzysto-włosy samuraj podejmuje się różnego rodzaju zajęć, przez które zwykle wpada w niemałe tarapaty. Kłopoty lubią przyciągać także jego przyjaciele: Kagura i Shinpachi. Jednak co by się nie działo, ta trójka nigdy nie traci ducha i potrafi wyjść cało nawet z największych opresji.

Głównym bohaterem, jest Allen Walker, szarowłosy chłopak, który przez swój wygląd wyraźnie rzuca się w oczy. Jednak nie bez powodu, gdyż Allen jest egzorcystą , osobą posiadającą Innocence, niezwykłą broń przeciw akumom. Co to akuma? Otóż, jest to straszliwa broń, maszyna z przytwierdzoną do niej ludzką duszą. Stwory te są tworzone przez niejakiego Milenijnego Earla. Allen wraz z grupą egzorcystów musi, powstrzymać akumy, gdyż potrafią one tylko zabijać. Co będzie dalej? Czy Allenowi i innym posiadaczom Innocence uda się powstrzymać Earla?

Ash i przyjaciele przybywają do zamku Camaron, gdzie odbywa sie turniej ku czci Strażnika Aury. Ash wygrywając turniej otrzymuje na jeden wieczór historyczne berło które posiadał wiele wieków wcześniej bohater Aaron. Kiedy Ketchum dostaje w dłonie berło budzi Lucario, Pikachu nagle znika. Ash rozpoczyna podróż do mistycznego drzewa, wraz z Lucario który obiecał pomóc w odnalezieniu Pikachu. Tym samym rozpoczyna się seria niefortunnych zdarzeń, która może ponownie postawić losy ziemi na krawędzi!

Ash rusza z pomocą uwięzionej matce i córce profesora Hale. Na jego drodze staje Unown, tajemniczy pokemon posiadający moc zamiany myśli w rzeczywistość.