Shidou Itsuka jest uczniem szkoły średniej, który mieszka ze swoją młodszą siostrą, Kotori. Kiedy zbliżające się trzęsienie ziemi zagraża bezpieczeństwu Tengu City, Shidou spieszy jej na ratunek, ale sam zostaje pochłonięty przez erupcję.
System Sibyl na bieżąco monitoruje stan psychiczny obywateli, określając prawdopodobieństwo popełnienia przez nich zbrodni. Używając go, członkowie Biura do Spraw Bezpieczeństwa Publicznego tropią potencjalnych kryminalistów.