Stacja Aragane zostaje zniszczona przez agresywne nieumarłe istoty znane jako Kabane. Grupa ocalałych wyrusza pancernym pociągiem w poszukiwaniu nowego schronienia.

Pomimo fizycznych braków Kuroko posiada niezwykły atut, który pozwala mu być jednym z najlepszych koszykarzy w szkolnej drużynie.

Akatsuki Ousawa to prawdziwy bohater z krwi i kości, któremu mimo młodego wieku nie dorównują nawet najwięksi wojownicy. Właśnie powrócił z równoległego świata zwanego Arezard, gdzie oswobodził licznych mieszkańców spod tyrani króla demonów i tu powinien nastąpić koniec opowieści, gdyby nie pewien szkopuł. Podczas ostatniej walki Akatsuki uhonorował życzenie konającego władcy i wziął pod opiekę jego nastoletnią córkę Miu. Po powrocie do naszego świata Ousawa wraz ze swoją nową przybraną siostrą trafiają pod skrzydła organizacji BABEL, która stara się wykorzystać potencjał drzemiący w ich nadnaturalnych zdolnościach.