Po upadku Japonii w erze chaosu były urzędnik, dzięki sprytowi i elokwencji, dąży do zjednoczenia kraju i zostaje legendarnym strategiem.

W starożytnych Chinach 17-letnia dziewczyna, znana jako Maomao, została porwana i zmuszona do pracy jako służąca na cesarskim dworze. Dzięki swoim farmaceutycznym umiejętnościom i osobowości, staje się kluczową postacią w rozwiązywaniu medycznych tajemnic na dworze cesarza.

Kontynuacja wydarzeń z pierwszego sezonu Made in Abyss. Do podróżujących na dno Otchłani Riko i Rega dołącza Nanachi. Po przebyciu znajdującego się na piątej warstwie Oceanu Zwłok trafiają do placówki badawczej, gdzie swą siedzibę ma Bondrewd zwany Suwerenem Brzasku.

Naofumi Iwatani, Bohater Tarczy, zostaje fałszywie oskarżony o napastowanie księżniczki. Wyklęty przez swoich towarzyszy i królestwo którego miał bronić, postanawia działać na własną rękę.