Jeden z pasażerów międzygwiezdnego liniowca zostaje wybudzony kilkadziesiąt lat przed terminem. Świadomy swojego położenia, decyduje się na krok, który będzie miał nieodwracalne konsekwencje.
Imperium zostaje zastąpione przez Najwyższy Porządek, który dąży do zdobycia władzy nad galaktyką. Plany złowrogiej organizacji może pokrzyżować tylko Ruch Oporu.
Sydney Bristow jest podwójną agentką, która dzieli życie pomiędzy rozpracowywaniem tajnej organizacji terrorystycznej oraz zdobywaniem informacji dla CIA a byciem zwykłą studentką.
John Gustafson oraz Max Goldman zakopują topór wojenny i planują wesele swoich dzieci. W międzyczasie starają się nie dopuścić do otwarcia włoskiej restauracji prowadzonej przez ponętną wdowę.