W starożytnych Chinach 17-letnia dziewczyna, znana jako Maomao, została porwana i zmuszona do pracy jako służąca na cesarskim dworze. Dzięki swoim farmaceutycznym umiejętnościom i osobowości, staje się kluczową postacią w rozwiązywaniu medycznych tajemnic na dworze cesarza.

Rei Oohashi budzi się w ciele bohaterki swojej ulubionej gry. W nowej roli postanawia romansować z główną antagonistką.

Sana Hidaka do jedenastego roku życia wychowywał się w prowincjonalnym miasteczku Sakuranomori. Miał kilkoro wiernych przyjaciół, ale pewnego dnia wyjechał na wiele lat do Tokio. Po pięciu latach wraca do swojego rodzinnego miasteczka, już jako licealista. Wraca z nadzieją, że znów spotka swoich przyjaciół z przed kilku lat. Po drodze do swojego wynajętego mieszkania wstępuje do świątyni, gdzie prawie cały czas przebywał z przyjaciółmi. Zauważa jakąś piękną, długowłosą dziewczynę w stroju kapłanki shinto. Gdy po chwili zauważa chłopaka ucieka. Po jakimś czasie Hidaka dociera do mieszkania. Spotyka tam Aoi, która w dzieciństwie była właścicielką dość dziecinnego głosu. Teraz jest niską, trochę niezdarną dziewczyną w okularach. Poza tym, nic się w niej nie zmieniło. Następnego dnia zostaje przydzielony do klasy, w której spotka po latach swojego przyjaciela Shusuke i jego siostrę bliźniaczkę - Shuri. Jednak zaczyna się zastanawiać co się stało z jego najlepszą koleżanką ? śliczną Nanaką.

Cloud Strife wychodzi z cienia, aby uratować mieszkańców zniszczonego miasta Midgar, którzy cierpią na śmiertelną chorobę nazwaną Geostigma.

Inżynieria genetyczna osiągnęła w przyszłości bardzo wysoki poziom - naukowcy stworzyli ludzi idealnych - silnych, wytrzymałych a także pięknych, nazwano ich koordynatorami. Zawiść przeciętnych ludzi doprowadziła do opuszczenia przez koordynatorów ziemi i osiedlenia się ich na wielkich stacjach kosmicznych. Pewnego dnia niemy pokój został przerwany - ludzie atakują jedną z kolonii. Odpowiedź organizacji ZAFT stworzonej przez koordynatorów jest szybka - kontratak. Zaczęła się wojna...