Kiedy niewielki samolot rozbija się na kanadyjskim pustkowiu, jedyna ocalała z katastrofy osoba musi podjąć walkę z żywiołami i własnymi demonami, aby przeżyć.
Zastępczyni dyrektora CIA Erica Shepherd zostaje skazana na dożywotnie więzienie za zdradę stanu. Trzy lata później agent FBI Will Keaton potrzebuje jej pomocy w złapaniu groźnego terrorysty.
Gwiezdne Wrota: Atlantyda to najnowszy serial bazujący na tematyce z serialu Gwiezdne Wrota SG-1. Opowiada przygody całkiem nowych bohaterów w świecie Gwiezdnych Wrót. Akcja toczy się już po przygodach grupy SG-1 w odległej galaktyce. Jedynie w epizodach będziemy mogli zobaczyć członków słynnej już grupy SG-1.