Zmarł w Moskwie w Rosji. Przyczyną śmierci była nieudana operacja żołądka, podejrzewa się, że mogło to być zabójstwo.

Od 1926 do 1991 roku stolica dzisiejszego Kirgistanu Biszkek (miejsce urodzenia Frunzego) nosiła nazwę Frunze na jego cześć.