Boruto rozpoczyna swoją drogę ninja, chcąc wydostać się z cienia ojca i zdobyć nowe umiejętności oraz przyjaciół.

Shidou Itsuka jest uczniem szkoły średniej, który mieszka ze swoją młodszą siostrą, Kotori. Kiedy zbliżające się trzęsienie ziemi zagraża bezpieczeństwu Tengu City, Shidou spieszy jej na ratunek, ale sam zostaje pochłonięty przez erupcję.