Hrabia Ciel i jego kamerdyner Sebastian próbują rozwiązać sprawę tajemniczych zaginięć studentów w Weston College.

Połączone siły Imperium Mocy Tsukasy oraz Królestwa Nauki chcą dopłynąć na drugi koniec świata, by poznać tajemnice jasnego świtała, które doprowadziło ludzkość do zagłady.

Na skutek tajemniczego rozbłysku światła cała ludzkość zostaje zamieniona w kamień. Po trwającej kilka tysięcy lat petryfikacji Taiju oraz jego genialny przyjaciel Senku wybudzają się i przystępują do odbudowy zniszczonej cywilizacji.

Baki ciężko trenuje, by przewyższyć siłą swojego ojca Yurijo - najsilniejszego wojownika na Ziemi.

"Senpai" jest potajemnie zakochany w "Otome". Szuka jej nocą w Ponto-cho, na targu używanych książek w świątyni Shimogamo, na jarmarku uniwersyteckim... Ale ona nigdy nie zdaje sobie sprawy z jego uczuć i za każdym razem, gdy "przypadkiem" na nią wpada, mówi po prostu "Co za zbieg okoliczności!". Czeka ich seria niezwykłych wydarzeń z obsadą wyjątkowych postaci. Sztuka Guerilla Theater "Henkutsuou" ("The Codger of Monte Cristo") pojawi się jako sztuka wewnątrz anime w formie kompletnego musicalu. Otome, Reżyser, Don Underwear i Senpai będą śpiewać! Zobaczysz również znajome twarze z "The Tatami Galaxy". Czy Senpai kiedykolwiek uda się przekonać Otome do swojej miłości?

17-to letni Yoshiharu Sagara, uczeń liceum przenosi się w czasie i zauważa, że znalazł się w centrum bitwy z okresu Sengoku. Przed śmiercią ratuje go słynny Hideyoshi Toyotomi, lecz w rezultacie mężczyzna sam ginie od zabłąkanej kuli. W obawie przed wypaczeniem historii, Yoshiharu zajmuje jego miejsce i zostaje jednym z doradców Nobuny Ody.

Pomiędzy Unią, a Deague toczy się wieloletnia wojna międzygwiezdna. Ralph to wyjątkowo zdolny pilot mecha typu Strain walczący po stronie Unii, którego umiejętności są stawiane za wzór kandydatom na nowych pilotów. Młodsza siostra Ralpha, 16-letnia Sara pragnie zostać pilotem i przyłączyć się do walki u boku brata. Pewnego dnia Deague atakuje obóz treningowy Sary, a na czele napastników stoi nie kto inny jak sam Ralph. Sara postanawia za wszelką cenę odnaleźć brata i dowiedzieć się dlaczego zdradził Unię i przyłączył się do wroga.

Seele organizuje zmasowany atak na NERV, próbując zniszczyć Evy, zanim Gendo uruchomi Trzecie Uderzenie i Projekt Dopełnienia Ludzkości.

Wbrew swojej woli Ikari Shinji zostaje wybrany na pilota Evangeliona, humanoidalnego robota, który broni Ziemi przed kosmicznymi najeźdźcami. Zamknięty w sobie chłopak zmaga się nie tylko z przeciwnikami, ale i samym sobą.