Agentka FBI Olivia Dunham wraz z genialnym naukowcem Walterem Bishopem i jego synem Peterem tworzą zespół prowadzący śledztwa dotyczące serii zagadkowych zdarzeń.
Sydney Bristow jest podwójną agentką, która dzieli życie pomiędzy rozpracowywaniem tajnej organizacji terrorystycznej oraz zdobywaniem informacji dla CIA a byciem zwykłą studentką.