Covert One to ściśle tajna amerykańska agencja wywiadowcza grupująca wybitnych ekspertów z różnych dziedzin życia. jej zadaniem jest walka z korupcją wśród elit władzy. Były agent Covert One, pułkownik Jon Smith i jego przyjaciółka doktor Sophie Amsden pracują w USAMRIID (United States Army Medical Research Institute for Infection Diseases). Specjalizują się w zwalczaniu chorób zakaźnych. Trzech amerykańskich żołnierzy stacjonujących w Afganistanie umiera po zarażeniu wirusem. Okoliczności ich śmierci bada Sophie i wkrótce spotyka ją ten sam los. Jon Smith postanawia wyjaśnić przyczynę jej śmierci i odkrywa, że nie była ona przypadkowa. Spowodował ją wirus podobny do Eboli. Jego rozprzestrzenienie się może doprowadzić do pandemii, która pozbawi życia miliony ludzi. Podobne przypadki zanotowano w Camp Pendleton, Seattle i Guantanamo Bay na Kubie. Istnieje podejrzenie zaplanowanej akcji terrorystycznej. Jon dociera do agentki Rachel Russel z zespołu Covert One. Razem próbują dotrzeć do prawdy. Walczą z czasem, by zlokalizować pochodzenie śmiertelnego wirusa i uprzedzić działania terrorystów.