Zdesperowany absolwent gimnazjum udaje się do świątyni po tym jak po raz setny dostał kosza od dziewczyny. Bóg Miłości sprawia, że jego los się odmienia, lecz jest jeden haczyk.

Po latach spokoju statek Sidonia ponownie staje w obliczu zagrożenia ze strony Gauna. Nagate Tanikaze bierze udział w działaniach mających na celu ochronę statku i jego mieszkańców.