Hiro wraz ze swoimi przyjaciółmi stara się rozwiązać zagadkę coraz częściej występujących zjawisk paranormalnych oraz stojących za nimi "Hologramowych Duchów".

Po pokonaniu Majin Buu na Ziemię powraca pokój. Jednak w odległej galaktyce pojawia się nowe zagrożenie – przebudzony bóg zniszczenia, Beerus.

Użytkownicy tytułowej gry zostają w niej uwięzieni. Kirito postanawia uwolnić wszystkich z wirtualnej pułapki.