Młodzi bohaterowie zasiadają za sterami biomechanicznych robotów, aby bronić Ziemi przed atakami obcych istot.

Będący w posiadaniu magicznego artefaktu Yugi zmuszony jest stanąć do walki o duszę dziadka podczas turnieju karcianego.

W XXI wieku, meteoryt uderzył w Antarktykę. Po tym jak naukowcy chcieli zbadać to zjawisko, nastąpiła ogromna eksplozja, zaklasyfikowana jako "Drugie Zderzenie". Shinji Ikari jako czternastoletni chłopiec wyjechał do Tokyo3, żeby zobaczyć się z ojcem, który zostawił go wiele lat temu. W czasie jego przyjazdu miasto zmienia się w pole bitwy z ogromnymi potworami, zwanymi "Aniołami". Okazuje się, że Shinji jest w stanie zsynchronizować się z ogromnym robotem - Evangelion 01. Zostaje pilotem maszyny i staje w obronie miasta. W tle jego zmagań pojawiają się odpowiedzi na wiele pytań dotyczących "Aniołów", "Drugiego Zderzenia" czy walki człowieka z Bogiem...

Miaka i Yui wybrały się pewnego razu do Biblioteki Narodowej. Znalazły tam Księgę Czterech Bóstw, która przeniosła je do dawnych Chin... Rywalizacja przyjaciółek zaczyna się wtedy, gdy Miaka zostaje kapłanką jednego z bóstw, Suzaku, a Yui kapłanką Seiryiu - no i oczywiście kiedy... zakochują się w tym samym chłopaku. Każda z nich będzie musiała odnaleźć siedmiu wojowników swojego bóstwa, a następnie to bóstwo przywołać.