Kwiat japońskiej młodzieży wraz z kapitanem Tsubasą jedzie reprezentować swój kraj na Międzynarodowym Turnieju Juniorów we Francji.

Tsubasa Oozora rozpoczyna piłkarską karierę i walczy o spełnienie swoich największych marzeń, w tym występ na mistrzostwach świata z reprezentacją Japonii.

Porphyras i jego siostra tracą rodziców w wyniku trzęsienia ziemi. Zamiast sierocińca wybierają pełną przygód podróż po Europie.

Młodzi bohaterowie zasiadają za sterami biomechanicznych robotów, aby bronić Ziemi przed atakami obcych istot.

Wbrew swojej woli Ikari Shinji zostaje wybrany na pilota Evangeliona, humanoidalnego robota, który broni Ziemi przed kosmicznymi najeźdźcami. Zamknięty w sobie chłopak zmaga się nie tylko z przeciwnikami, ale i samym sobą.

Yusuke Urameshi ginie, ratując dziecko spod kół samochodu. Duch Świata, będąc pod wrażeniem poświęcenia chłopca, daje mu szansę na drugie życie.

Sheeta i Pazu wyruszają w niezwykłą podróż, aby odnaleźć legendarny latający zamek.