Minęło 40 lat odkąd 12 ludzkich kolonii słyszało po raz ostatni o swoich "dzieciach" Cylonach, inteligentnych maszynach, które wyzwoliły się i wypowiedziały wojnę swoim panom i stwórcom - ludziom, a następnie zniknęli. W nagłym niszczycielskim ataku Cyloni powrócili i zniszczyli ludzkie kolonie. Zwycięstwo ułatwiło im to, iż część z nich wygląda już jak ludzie. Atak zmusił Komandora Williama Adamę do przywrócenia do gotowości bojowej jego statek wojenny-muzeum, Battlestar Galactica i wraz z pilotami myśliwców stacjonujących na Battlestar rozpocząć walkę z najeźdźcą. Niestety walka z agresorem jest trudna i Komandor Adama zmuszony jest prowadzić niewielką flotę ocalałych ludzi w samotną wędrówkę w poszukiwaniu trzynastej kolonii - planety zwanej Ziemią.
Podczas Wielkiego Kryzysu chłopiec z farmy w Oklahomie oraz charyzmatyczny pastor dowiadują się, że są głównymi graczami w grze przedstawicieli Nieba i Piekła.
Sam Beckett jest naukowcem, który chciał udowodnić, że człowiek może podróżować w czasie. Razem z grupą innych fascynatów tej teorii tworzą akcelerator, który ma mu to umożliwić. Kiedy Beckett dostaje się do maszyny udaje mu się rzeczywiście przenieść w czasie, ale jest kilka minusów. Po pierwsze jest tylko duszą w ciele innej osoby, a po drugie nie może wrócić do swoich czasów !!! Potem orientuje się, że ludzie, do których ciał trafił znajdują się na życiowym zakręcie, który właśnie Beckett musi rozwiązać. Pomaga mu w tym Al, znajomy z instytutu pod postacią hologramu. Po każdej wypełnionej misji doktor jest przenoszony do innego miejsca w innym czasie - niestety Beckett nigdy nie wie co to będzie za miejsce, dlatego jego droga do domu będzie bardzo długa. Serial ten składa się w sumie z 97 odcinków.