Gdy Atsushiego Nakajimę wyrzucono z sierocińca, został bez jedzenia i dachu nad głową. Przypadkowo ratuje człowieka o nazwisku Dazai, który w nagrodę wciela go do tajnej agencji.
Życie młodego Naoty ulega radykalnej zmianie, gdy na swojej drodze spotyka tajemniczą Haruko, kosmiczną łowczynię nagród uzbrojoną w elektryczną gitarę.
Nastoletnia Utena rozpoczyna naukę w nowej szkole. Wierzy, że sprowadził ją tam pierścień od tajemniczego księcia, który ma pomóc ponownie im się spotkać.
Wbrew swojej woli Ikari Shinji zostaje wybrany na pilota Evangeliona, humanoidalnego robota, który broni Ziemi przed kosmicznymi najeźdźcami. Zamknięty w sobie chłopak zmaga się nie tylko z przeciwnikami, ale i samym sobą.
Kolejny wróg czarodziejek - Cyrk Martwego Księżyca przybywa do Tokio, by złapać ukrywającego się w ludzkich marzeniach Pegaza i zawładnąć Złotym Kryształem.