Maltański rybak mierzy się z nowo odkrytym wyciekiem w swojej drewnianej łodzi. Zdesperowany, by utrzymać żonę i malutkiego syna bohater stopniowo angażuje się w nielegalną działalność.
Dzięki przełomowej technologii Callum Lynch doświadcza przygód swojego przodka, asasyna Aguilara, żyjącego w XV-wiecznej Hiszpanii. Wkrótce podejmuje walkę z potężnymi templariuszami.