Po globalnym kryzysie finansowym świat pogrąża się w "zrównoważonej wojnie" prowadzonej przez sztuczną inteligencję. Zadaniem Sekcji 9 jest walka z cyberzagrożeniami.

Starożytne Chiny, Okres Walczących Królestw (475-221 p.n.e). Shin i Hyou są sierotami wojennymi mieszkającymi w Królestwie Qin. Ich wspólnym marzeniem jest zostanie "największymi siogunami na świecie". Pewnego dnia Hyou dostaje od ministra ofertę pracy i przenosi się do pałacu. Po jakimś czasie wraca jednak do wioski, będąc przy tym ciężko rannym. Na łożu śmierci ma do Shina ostatnią prośbę, która dotyczy odnalezienia i ochrony Ei Seia. Chłopiec okazuje się łudząco podobnym do Hyou młodym cesarzem Qin.

Sana Hidaka do jedenastego roku życia wychowywał się w prowincjonalnym miasteczku Sakuranomori. Miał kilkoro wiernych przyjaciół, ale pewnego dnia wyjechał na wiele lat do Tokio. Po pięciu latach wraca do swojego rodzinnego miasteczka, już jako licealista. Wraca z nadzieją, że znów spotka swoich przyjaciół z przed kilku lat. Po drodze do swojego wynajętego mieszkania wstępuje do świątyni, gdzie prawie cały czas przebywał z przyjaciółmi. Zauważa jakąś piękną, długowłosą dziewczynę w stroju kapłanki shinto. Gdy po chwili zauważa chłopaka ucieka. Po jakimś czasie Hidaka dociera do mieszkania. Spotyka tam Aoi, która w dzieciństwie była właścicielką dość dziecinnego głosu. Teraz jest niską, trochę niezdarną dziewczyną w okularach. Poza tym, nic się w niej nie zmieniło. Następnego dnia zostaje przydzielony do klasy, w której spotka po latach swojego przyjaciela Shusuke i jego siostrę bliźniaczkę - Shuri. Jednak zaczyna się zastanawiać co się stało z jego najlepszą koleżanką ? śliczną Nanaką.