Zen Gesner jest synem aktorki Nan Martin i architekta Harry'ego Gesnera. Rodzice nadali mu imię na cześć nurtu buddyzmu, który wyznawali. Ma troje starszego rodzeństwa z ich poprzednich małżeństw: braci Caseya Martina Dolana i Jasona Gesnera oraz siostrę Tarę Tanzer-Cartwright. Jako chłopiec interesował się muzyką, umie grać na trąbce i pianinie. Już uczęszczając do Santa Monika High School, marzył o tym, by pójść w ślady matki i brał udział w szkolnych przedstawieniach. Będąc studentem LAMDA, nie tylko grał w sztukach teatralnych, ale uczył się m.in poezji, łucznictwa i dmuchania ogniem. Na drugim roku skoncentrował się na szermierce i zdobył certyfikat na poziomie zaawansowanym. Jako świeżo upieczony absolwent LAMDA,  był asystentem reżysera w Londyńskiej Royal Opera.W 1995 roku ożenił się z Cynthią Farrelly, najmłodszą siostrą  Petera i Bobby'ego Farrellich - producentów, reżyserów i scenarzystów komediowych. W 1996 otrzymał tytułową rolę w swoim pierwszym serialu "Przygody Sindbada Żeglarza", kręconym w Kapsztadzie (RPA). Wszystkie kaskaderskie sceny wykonał sam. Od lokalnej cyrkowej trupy nauczył się m.in. chodzenia po linie. W odcinku "The Invaders" pojawił się jego najstarszy syn Finn. Produkcja serialu zakończyła się w 1998 roku. Następnie Zen występował w operze mydlanej "All my children" jako Braden Lavery. Do tej pory zagrał także, głównie role epizodyczne, w ich 9 filmach braci Farrelly, łącznie z debiutem w "Głupim i głupszym". Zen, Cynthia i ich trzej synowie mieszkają w Malibu.