Akcja rozgrywa się w mitycznym świecie, w którym żyją ludzie oraz potwory zwane Yoma. Żywią się one ludzkimi wnętrznościami. Potrafią także ukrywać się w ciele człowieka. Są niezwykle silne dlatego do walki z nimi tajemnicza Organzacja stworzyła super wojowniczki nazwane przez ludzi Claymore. Są to mutanty, które mają w sobie krew i ciało Yoma. W walce są bardzo silne, ponieważ mogą uwolnić z siebie moc potwora, wtedy to ich srebrne oczy przybierają kolor złoty. Jedynym niebezpieczeństwem jest to, że po przekroczeniu pewnego limitu Yoma zaczyna panować nad ich ciałem i stają się Przebudzonymi - stworami, które naprawdę trudno pokonać.
Główną bochaterką jest Clare. Została ona wojowniczką z jednego powodu - pragnienia zemsty na Przebudzonym - Priscilli, który zabił jej opiekunkę i przyjaciółkę Teresę o Delikatnym Uśmiechu.
Clare pewnego dnia poznaje chłopca imieniem Raki. Początkowo jest dla niego oschła, ale z biegiem czasu rodzi się między nimi przyjaźń. Zostaje on jej kucharzem. Podróżują razem walcząc z Yoma. W końcu dochodzi do decydującej walki Clare z Priscillą...

W świecie spustoszonym przez krwiożercze demony Yoma jedynym ratunkiem dla zdesperowanej ludności są Claymore, wojowniczki, które dzięki płynącej w ich żyłach krwi demonów, jako jedyne są w stanie pokonać Yoma.
Główna bohaterka, Clare, jest właśnie jedną z nich. Samotnie podróżuje z miasta do miasta, ścinając głowy kolejnych bestii. Pewnego dnia, podczas jednej ze swych misji poznaje Rakiego. Osierocony chłopak, którego cała rodzina padła ofiarą demonów, postanawia przyłączyć się wojowniczki. Wspólnie wyruszają w długą podróż, której celem będzie walka ze złem, a przede wszystkim prywatna vendetta Clare, która pragnie pomścić śmierć swej ukochanej mentorki.