Leniwy licealista Houtarou Oreki za namową swojej starszej siostry dołącza do szkolnego Klubu Literatury Klasycznej. Spotyka tam piękną dziewczynę o imieniu Eru, która jest prawdziwym uosobieniem ciekawości. Kiedy Eru jest czymś zainteresowana chłopiec nie może oprzeć się jej urokowi i wbrew własnej woli zmuszony jest do pomocy. Gdy okazuje się, że Houtarou ma wrodzony talent do rozwiązywania zagadek, dziewczyna prosi go o wyjaśnienie sprawy sprzed 45 lat, z którą powiązany był jej zaginiony wujek.