10 lat od zdobycia przez drużynę Inazuma Japan pucharu FFI zmieniła się młodzieżowa piłka nożna w Japonii, gdyż zawładnęła nią tajemnicza organizacja Piąty Sektor. Główny bohater, Matsukaze Tenma, próbuje dostać się do piłkarskiego klubu w gimnazjum Raimona i szybko uświadamia sobie, że obecna dyscyplina sportu znacznie różni się od tego, jak ją sobie wyobrażał. Matsukaze Tenma wraz z członkami zespołu Raimon chce przywrócić dawną wolną piłkę nożną, aby każdy mógł w nią grać swobodnie.