Niecały rok od wydarzeń z Macross 7 serii TV, Basara opuszcza bombowiec i udaje się
w podróż na Ziemię. Na planecie poznaje dziewczynę imieniem Elma, która jest wielką fanką statku bombowca. Okazuje się, że po raz kolejny Basara będzie musiał użyć swoich mocy, tym razem jego zadaniem będzie powstrzymać armię kłusowników z ojcem Elmy, Grahamem na czele, przed zabiciem stada kosmicznych wielorybów, które podróżują w obrębie systemu planetarnego.