Główni bohaterowie to rodzeństwo Jun i Nori Sakurada. Ich rodzice wyjechali. Nori zajmuje się rozkapryszonym braciszkiem, który siedzi tylko przed komputerem i zamawia przeróżne rzeczy przez internet. Pewnego dnia dostaje paczkę, w której znajduje się lalka - Shinku - piąta lalka Rozen Maiden. Wkrótce ożywa po nakręceniu przez Juna. Jest to prawdziwa arystokratka. Uwielbia pić herbatę w swojej małej filiżaneczce oraz traktuje Juna jak swojego sługę, ponieważ zgodził się on zostać medium, czyli osobą dostarczającą jej energię.
Wkrótce w domu Sakuradów pojawiają się następne lalki. Wszystko prowadzi do rozpoczęcia gry Alicji a stawka jest wysoka, ponieważ Rozen Maiden walczą o swoje Rosa Mistica, dzięki którym nie są zwykłymi zabawkami. Wygrać może tylko jedna a nagrodą jest spotkanie z Ojcem - lalkarzem, który je stworzył.