33 lata temu, obca siła - Jam - odwiedziła Ziemię, przez wymiarowy portal obok Antarktydy. Ziemska siła kieruje Jam na odległą olanetę, zaprojektowaną jako Fairy. Podczas gdy większość ludzkiej populacji jest nieświadoma obecności Jamu, wojna kontynuowana jest na Fairy. Sentou Yousei Yukikaze opowiada życie Rei Fukai pilota SAF'u (specjalnej siły powietrznej), która określana jest również jako "Yukikaze" - zaawansowanego samolotu myśliwskiego.

Wiele lat po tym jak ziemia została zaatakowana przez obcą rasę, ludzie wypędzili obcych i teraz siły FAF`u toczą walkę z nimi na ich rodzimej planecie. Ta jednak kryje wiele tajemnic. Młody pilot myśliwca wywiadowczego Yukikaze ? Rei Fukai spróbuje odkryć prawdę, jakiej nigdy poznać nie chciał...