W odcinku pt. "Pranie mózgów" Pani Frał sprawdzając obecność oprócz nazwisk głównych bohaterów, mówi również nazwiska innych uczniów, które są nazwiskami aktorów podkładających głosy w serialu. Natomiast w odcinku "Karnawau" chłopcy zobaczyli dziennik, lecz tam nazwiska były już inne.
Na żadnej z list nie pojawia się Zajkowski ani Karolina, mimo że wiadomo o ich przynależności do tej klasy.
W odcinku "Memęto Mori" podczas mszy widać mleczarkę, kustosza, Mariolę Wasilak, babcię Anusiaka, robota pani dyrektor oraz Mariana Kalinę mimo, że część z nich zginęła w poprzednich odcinkach.
Część akcji odcinka "Kompu Kompu" jest złudzeniem. Dodatkowo na basenie w pewnym momencie widzimy bawiące się dwie takie same dziewczynki i dwóch takich samych chłopców.
W odcinku "Jasełki" Czesio rozmawia z Przekliniakiem i nikt nie zwraca na to uwagi, ale Pani Frał nakrzyczała na Anusiaka, gdy powiedział że Przekliniak nie lubi Przytulaska.
W odcinku "Jasełki" siostra wyprasza Czesia za drzwi, gdy Higienistka przyprowadza Zajkowskiego, bohater siedzi w ławce, a później zostaje znów poproszony do klasy.
W odcinku "Gigant" w klasie nad tablicą zamiast krzyża pojawia się godło Polski.
W odcinku "Gigant", na dworcu głównym, gdy kamerę skierowano na Konieczkę, ten nie ma włosów.
W odcinku "Pochót" Andżelika siedziała na początku, tam gdzie zawsze, a później w tym samym rzędzie, co Czesio i Maślana.
W odcinku "Czech, Cześ i Brambor", Konieczko wpisał na klawiaturze "cjanev;" a wyświetliło się "brambor".
W odcinku "Szczypionka dla Frycka", Higienistka robi zastrzyk głównym bohaterom w lewą rękę, lecz gdy idą do domu to znamię, mają na prawej ręce.
W odcinku "Piure dla słonia", Zajkowski w momencie, gdy był przy klatce z szympansami miał 3 uszy.
W pewnym momencie odcinka "Jasełki", zamiast katechetki pojawia się Pani Frał.
W odcinku "Komp-Kompu", w chwili, w której chłopcy wypadali z zalanego mieszkania, Czesio miał na sobie akwalung.
W odcinku "Wójek Alfred", tytułowy manekin, kiedy był w klasie, miał odsłonięte wnętrzności po prawej stronie klatki piersiowej, a kiedy był z Czesiem w kaplicy, miał je odsłonięte po lewej.
W odcinku "Gangsta-dewasta", Czesio miał wspomnienia jak jeden z łobuzów z VI c wyjął nóż, chociaż w czasie napadu na Czesia, nic takiego się nie wydarzyło.
W odcinku "Gangsta-dewasta", Panczandragon powinien zabić swoim ogniem Pikulskiego i Frosika, tak samo jak chłopców w odcinku "Pozytywne wibracje".
W odcinku "Gangsta-Dewasta" Elf Maślana na początku miał kolczugę, a gdy był na Panczandragonie już jej nie miał.
W odcinku "Gangsta-Dewasta", Demon który walczył z Paladynem Siekaczem nie zaatakował bandytów Pikulskiego i Frosika.
W odcinku "Barbakiu z Mruczusiem", gdy Higienistka wchodzi by uratować Bertę, jest ubrana na czarno. Gdy wychodzi z domu ma na sobie białe ubrania.
W odcinku "Andżelika" Higienistka twierdzi, że Marcel poprosił ją o chodzenie za czasów szkolnych, a w odcinku "Styl Brusliego", że poznali się 15 lat temu, kiedy byli przeciwnikami w karate.
W odcinku "Kanau" bohaterowie są w szkole i obchodzą rocznicę Powstania Warszawskiego, a przecież są wakacje.
W odcinku "Kólik z Pruchem" bandaż na głowie Andżeliki znika zaraz po założeniu.
W odcinku "Kólik z Pruchem" chłopcy podczas jazdy na sankach ściągają i wyrzucają rękawiczki. W następnym ujęciu Maślana i Czesio nadal mają założone rękawiczki.
Bohaterowie w większości nie mają imion. Ci, którzy mają imiona (Czesio, Andżelika, Marcel) – zazwyczaj nie mają nazwisk. W przypadku Czesia jest to powiedziane bezpośrednio (w odcinku Nazywam się Anusiak Anusiak stwierdza, że Czesio nawet nie ma nazwiska, żeby się ponabijać), a oficjalnie Czesio nazywany jest Czesławem (lub "uczniem Czesławem"). Niektórymi wyjątkami od tej reguły są Higienistka, Pułkownik i Mleczarka, którzy nie mają ani imienia, ani nazwiska oraz Mariola Wasilak, Radosława Krajowiak (odcinek Deszcze Niespokojne) i Maria Skłodowska-Curie (Pochót).
W każdym odcinku Konieczko siedzi w ławce z Anusiakiem w następującym układzie: Konieczko przy oknie, Anusiak od strony przejścia. W odcinku Maksymalna kontrola oraz Romek i jego Fred siedzą odwrotnie.
W laboratorium Konieczki na ścianie wisi mapa tolkienowskiego Śródziemia.
W odcinku Wiedźma Shigella wykorzystano fragmenty interfejsu gry World of Warcraft.
Scena, w której Czesio przytulił się z Misiem po jego znalezieniu na wzgórzu przy zachodzącym słońcu do złudzenia przypomina tę z filmu o Kubusiu Puchatku, gdzie w tej samej sytuacji przytulili się Kubuś i Krzyś.
Wszystkie postacie są wykonane w technologii dwuwymiarowych sprite'ów z wyjątkiem Misia Przekliniaka, który jest w pełni trójwymiarowy. W niektórych scenach (np. gdy jakaś postać się przewraca) są ona pokazane z innego ujęcia i widać ich "płaskość".
W odcinku "Pranie mózgów", podczas sprawdzania przez Panią Frał obecności pojawiają się prawdziwe nazwiska i głosy aktorów.
W odcinku "Motorynka i myszykiszki" gdy Anusiak wraz z rodziną jest w szpitalu u dziadka, i dziadek dostaje zapaści to przybiega lekarz z pielęgniarką. Ta pielęgniarka wyglądem przypomina Pannę Frał.
W odcinku "Fluder" występuje identyczny kot, jaki wystąpił w odcinku "Barbakiu z Mruczusiem".
Wszystkie znane postacie które grają w Magicznych Wojowników mają podobnych do siebie bohaterów oprócz Higienistki.
Rodzice Anusiaka, Maślany i Konieczki są pokazywani tylko nogami jak rodzice z bajki Krowa i Kurczak. Sam autor przyznaje, że to jedna z jego ulubionych kreskówek.
W odcinku "Mikołajki", scena ulicy na którą Czesio przewracał słupy, jest podobna do sceny ze "Świtu żywych Trupów".