"Commander: Europe at War" bazuje na wydarzeniach z okresu II wojny światowej i pozwala graczom zmienić bieg historii. W trakcie rozbudowanych kampanii mamy możliwość prowadzenia działań wojennych na wszystkich obszarach ogarniętych konfliktem podczas wojny Bitwy toczymy zarówno w Europie (na terenach okupowanej Francji, Rosji czy Wielkiej Brytanii), bierzemy udział w operacjach północnej Afryce, a także walczymy na wodach należących do Stanów Zjednoczonych. W grze nie zabrakło oczywiście historycznych kampanii: kierując poczynaniami obu stron konfliktu weźmiemy udział choćby w lądowaniu wojsk alianckich w Normandii, mamy okazję przełamać francuską linię umocnień Maginota czy przypuścić atak na ZSSR w ramach operacji Barbarossa.