"Enemy Zero" jest przygodową grą akcji, osadzoną w klimatach horroru sci-fi. Jej akcja przenosi nas na pokład statku kosmicznego o nazwie AKI. Jednym z członków załogi, a zarazem główną bohaterką gry jest Laura Lewis. Podczas jednego z rejsów kosmicznych, na pokład promu dostaje się obca forma życia. Intruz okazuje się śmiertelnie niebezpieczny, a na domiar złego jest niewidzialny gołym okiem. Naszym zadaniem będzie pozbycie się nieproszonego gościa przy jednoczesnym unikaniu bezpośredniego starcia z nim. W czasie przemieszczania się po statku, Laura będzie miała do dyspozycji specjalne urządzenie o nazwie VPS, które wykrywa niewidzialne przeszkody, dzięki wykorzystywaniu fal dźwiękowych.