Gra „Scooby-Doo: Muzealna draka z powodu robaka” zawiera zadania o istotnych walorach edukacyjnych. Sprawdzają one umiejętność planowania i rozkładania czynności w czasie, uczą logicznego myślenia, eliminacji, stosowania strategii, sprawdzania hipotez i rozwiązywania problemów. Program pomaga ćwiczyć pamięć, percepcję przestrzenną i koordynację ruchów. Poprzez proces przypisywania wskazówek do podejrzanych gra zachęca do rozumowania na sposób „prawdziwych detektywów”. Gracze zbierają wskazówki i porównują je z cechami każdego podejrzanego, a następnie klasyfikują wskazówki i postaci, posługując się myśleniem dedukcyjnym do zawężenia listy podejrzanych. Dodatkowa zaleta - i zarazem nowość - to zestaw kilkudziesięciu zagadek, kolorowanek, łamigłówek i puzzli z ulubionymi bohaterami, które zapewnią dziecku wiele godzin zabawy nawet po odejściu od komputera.