Część 3 - "Ogień" - po uratowaniu przez pająka pułkownik Miles udaje się ma banicję. Zhańbiony kolejną porażką nie chce wracać do ludzi. Podczas tułaczki natrafia plemię popiołu. Przyjmują go do siebie, po tym jak Miles przechodzi próby ognia. Plemię prowadzi wędrowny tryb życia atakując inne Navi i wypalając tereny na których się osiedla. Pułkownik bez problemu przekonuje ich żeby zaatakować wodne plemię. W finale plemiona brutalnie walczą ze sobą. Jake zostaje prawie śmiertelnie poparzony, pająk ginie, a Neytiri traci oko. Ostatecznie Miles trafia do niewoli, a plemię popiołu poddaje się uznając Kiri za żywe wcielenie Eywy, ponieważ okazuje się, że umie ona kontrolować ogień
W części 3 u ludzi niewiele się dzieje poza tym ze przybywają posiłki z Ziemi i
wiadomości że na ojczystej planecie jest coraz gorzej.
Część 4 - "Matka Ziemia" -głęboko pod ziemią ludzie odkrywają kolejny cudowny pierwiastek Pandory, Cleanium. Filtry wykonane z Cleanium potrafią usunąć 100% zanieczyszczeń z wody, powietrza i gleby. Ludzie chcą to wykorzystać do ratowania Ziemi i kolonizacji innych planet. błyskawiczna gospodarka rabunkowa powoduje katastrofalne trzęsienia ziemi na Pandorze. Kiri wyczuwa, że mogą one dosłownie rozerwać Pandorę i wiedziona instynktem wyrusza na poszukiwanie plemienia Mroku, żyjącego w jaskiniach i tunelach drążonych przez ogromne czerwie. Pleamiona wszystkich żywiołów jednoczą się. Miles ucieka z Niewoli zbijając Neytiri i udaje się do ludzi aby ostrzec ich przed armią Navi
Cześć 5 - "Jedność" Zjednoczone plemiona planują atak na ludzi. Kiri ma wizje wojny totalnej która niszczy Pandorę. Nie chcąc do niej dopuścić wyrusza do ludzi aby z nimi negocjować. W międzyczasie z Ziemi przybywają nowe jednostki wojskowe, które pod wodzą generała i pułkownika mają odeprzeć atak Navi. Kiri dostaje się do niewoli, nie udaje jej się przekonać ludzi do pokojowego rozwiązania. Dochodzi do masakrycznej walki, którą nagle przerywa ogromne trzęsienie ziemi wywołane przez Kiri. Podczas walk została uwolniona przez naukowców którzy jako jedyni byli jej przychylni. Kiri tłumaczy generałowi, że dalsza walka zniszczy Pandorę i zniszczy plany ratowania Ziemi. Miles nie słucha i rzuca się na przycisk odpalania atomówek, powstrzymuje go generał, zabijając go. Nastaje pokój. Navi zgadzają się pomóc Ziemianom w ocaleniu ich planety i przekazują niezbędne materiały. Zgadzają się też aby ludzie mogli zamieszkać na Pandorze. Jake zostaje śmiertelnie ranny, ale wie że ocalił obie planety. Poprzednie części kończyły się najazdem na otwierające się oczy Navi, tak kończy się jak je zamyka.