Planeta karaluchopodobnych kosmitów umiera. Wysłani, by skolonizować Ziemię, z tajnej kryjówki w parku rozrywki, obcy kontrolują dwa kosmiczne potwory - Gigana i Króla Ghidorę. Z ich pomocą pragną zniszczyć ludzi i przejąć planetę. Powstrzymać ich mogą jedynie połączone siły Godzilli i Anguirusa.
Przesłuchanie znalezionej w Dziecięcym Parku Zabaw tajemniczej taśmy powoduje przebudzenie zahibernowanych na Wyspie Potworów, Godzilli i Anguirusa. Sygnały z tej samej taśmy, wykradzionej przez pragnących opanować Ziemię najeźdźców z kosmosu, przywołują z przestrzeni kosmicznej dwa potwory: Króla Ghidorę i Gigana. Ludzie nie są w stanie się przed nimi bronić.