Akcja "Space Battleship Yamato" rozgrywa się w XXII wieku. Ziemia została zaatakowana radioaktywnymi bombami przez rasę Obcych. Niedobitki ludzkości mieszkają w schronach zbudowanych głęboko pod powierzchnią. Niestety jeśli nic się nie zmieni, już wkrótce i tam dotrze śmiertelne promieniowanie. Nagle ludzkość otrzymuje nową szansę. W nie do końca jasnych okolicznościach otrzymują plany niezwykle zaawansowanej technologii, dzięki której mogą nie tylko przeciwstawić się Obcym ale też oczyścić powierzchnię Ziemi z niebezpiecznego zanieczyszczenia radioaktywnego. Tak budują kosmiczny okręt bojowy Yamato.