Młoda kobieta zmagająca się z nałogiem wchodzi w posiadanie kostki LeMarchanda nieświadoma, że ​​za jej pomocą przywoła cenobitów.

Związek Radziecki, rządy Stalina. Okryty niesławą oficer służb bezpieczeństwa rozpoczyna śledztwo w sprawie serii tajemniczych morderstw dzieci.

Po śmierci nowo narodzonego syna bogaty Amerykanin decyduje się na adopcję innego noworodka. Ukrywa jednak ten fakt przed żoną.

Fabularnie "Dzieci Diuny" łączy w sobie wątki z drugiego i trzeciego tomu cyklu: "Mesjasza Diuny" i "Dzieci Diuny". Tematem filmu jest walka Paula Atrydy z zakonem Bene Gesserit, który nie potrafi kontrolować Muad'Diba, a także wydarzenia, które miały miejsce po odejściu Paula na pustynię, kiedy rozpoczęła się Ekologiczna Transformacja Diuny, a na Arrakis pojawił się tajemniczy starzec zwany Kaznodzieją.