W opustoszałym, opanowanym przez bańki, nękanym anomaliami grawitacyjnymi Tokio młody człowiek spotyka tajemniczą dziewczynę. Ich znajomość jest brzemienna w skutki.

Spokojne życie członka yakuzy, Yoshifumiego Nitty, zostaje wywrócone do góry nogami, gdy w jego domu pojawia się tajemnicza dziewczynka obdarzona potężnymi mocami psychokinetycznymi.

Potomek Jonathana Joeastara, zwący się Jotaro Kujo, wyrusza do Egiptu, by uratować życie swojej matki, jak i pokonać tego, który czyha na krew jego rodziny.