Nagrody
54Oscary
Oscar - Najlepszy film za Ona (2013)
Oscar - Najlepszy reżyser za Być jak John Malkovich (1999)
Złote Globy
Złoty Glob - Najlepszy reżyser za Adaptacja (2002)
MFF w Wenecji - Biennale Cinema
Nagroda Międzynarodowej Federacji Krytyki Filmowej (FIPRESCI) - Sekcja równoległa za Być jak John Malkovich (1999) - za pomysłowo napisaną absurdalną satyrę połączoną z pasją reżyserską w wielkim stylu
Nagroda Specjalna - Nagroda Festiwalu Przyszłości Kina (Future Film Festival Digital Award) - Wyróżnienie specjalne za Być jak John Malkovich (1999)
Berlinale
Nagroda Grand Prix Jury - Srebrny Niedźwiedź - Najlepszy film za Adaptacja (2002)
Złoty Niedźwiedź - Udział w konkursie na najlepszy film krótkometrażowy za Scenes From The Suburbs (2011)
Złoty Niedźwiedź - Udział w konkursie głównym za Adaptacja (2002)
Emmy
Emmy - Najlepszy dokument lub dokumentalny program specjalny za Beastie Boys: ich historia (2020)
Emmy - Najlepszy scenariusz programu dokumentalnego za Beastie Boys: ich historia (2020)
Emmy - Najlepszy dokumentalny lub oparty na faktach program specjalny za Jim i Andy (2017) - Tony Clifton
Saturny
Saturn - Najlepszy scenariusz za Gdzie mieszkają dzikie stwory (2009)
Złote Maliny
Złota Malina - Najbardziej płytki film adresowany do młodzieży za Jackass - świry w akcji (2002)
Critics' Choice Awards
Critics' Choice - Najlepszy scenariusz oryginalny za Ona (2013)
Critics' Choice - Przełomowa rola roku za Być jak John Malkovich (1999), Złoto pustyni (1999) także za: Być jak John Malkovich (1999) , Złoto pustyni (1999)
Critics' Choice - Najlepszy reżyser za Ona (2013)
Satelity
Satelita - Najlepszy scenariusz oryginalny za Ona (2013)
Film Independent
Independent Spirit - Najlepszy film debiutancki za Synekdocha, Nowy Jork (2008)
Independent Spirit - Najlepszy film debiutancki o budżecie powyżej 500 tys. $ za Być jak John Malkovich (1999)
Cezary
Cezar - Najlepszy film zagraniczny za Być jak John Malkovich (1999)
WFF
Konkurs Filmów Krótkometrażowych - Udział w konkursie na najlepszy film krótkometrażowy za Umrzeć przy tobie (2011)
AFF
Sekcja "Dekada Niezależnych" - Udział w sekcji za Adaptacja (2002)
Amerykańska Gildia Producentów Filmowych
Złoty Laur - Nagroda im. Darryla F. Zanucka dla najlepszego producenta filmowego za Ona (2013)
Amerykańska Gildia Reżyserów Filmowych
DGA - Najlepsze osiągnięcie reżyserskie w filmie fabularnym za Być jak John Malkovich (1999)
Amerykańska Gildia Scenarzystów
Lista 101 najlepszych scenariuszy XXI wieku (*jak dotąd) - 17. miejsce za Ona (2013)
WGA - Najlepszy scenariusz oryginalny za Ona (2013)
Gotham
Nagroda Gotham - Najlepszy film fabularny za Synekdocha, Nowy Jork (2008)
Hugo
Hugo - Najlepsza prezentacja dramatyczna za Być jak John Malkovich (1999)
Internetowe Towarzystwo Krytyków Filmowych (OFCS)
OFCS - Najlepszy scenariusz oryginalny za Ona (2013)
OFCS - Najlepszy debiut filmowy za Być jak John Malkovich (1999)
OFCS - Najlepszy reżyser za Ona (2013)
OFCS - Najlepszy scenariusz adaptowany za Gdzie mieszkają dzikie stwory (2009)
OFCS - Najlepszy reżyser za Adaptacja (2002)
OFCS - Najlepszy reżyser za Być jak John Malkovich (1999)
National Board of Review
NBR - Najlepszy reżyser za Ona (2013)
Robert
Robert - Najlepszy film amerykański za Być jak John Malkovich (1999)
RomeFilmFest
Nagroda Marc’Aurelio - Udział w konkursie głównym za Ona (2013)
Stowarzyszenie Krytyków Filmowych z Chicago (CFCA)
Chicago Flame - Najlepszy scenariusz oryginalny za Ona (2013)
Chicago Flame - Najlepszy reżyser za Ona (2013)
Chicago Flame - Najlepszy reżyser za Gdzie mieszkają dzikie stwory (2009)
Chicago Flame - Najlepszy scenariusz adaptowany za Gdzie mieszkają dzikie stwory (2009)
Stowarzyszenie Krytyków Filmowych z Florydy (FFCC)
FFCC - Najlepszy scenariusz oryginalny za Ona (2013)
Stowarzyszenie Krytyków Filmowych z Georgii (GAFCA)
GAFCA - Najlepszy scenariusz oryginalny za Ona (2013)
Stowarzyszenie Krytyków Filmowych z Północnej Karoliny (NCFCA)
NCFCA - Najlepszy scenariusz oryginalny za Ona (2013)
Stowarzyszenie Krytyków Filmowych z San Diego (SDFCS)
SDFCS - Najlepszy scenariusz oryginalny za Ona (2013)
SDFCS - Najlepszy reżyser za Ona (2013)
Stowarzyszenie Krytyków Filmowych z San Francisco (SFBAFCC)
SFBAFCC - Najlepszy reżyser za Ona (2013)
SFBAFCC - Najlepszy scenariusz oryginalny za Ona (2013)