Dziesiąty już film z serii "Pokemon", opowiadający o stworkach, które posiadają nadludzkie moce, jak władanie ogniem, elektrycznością, wodą, lodem, ciemnością itp. Dwa potężne legendarne pokemony: Dialga i Palkia, prowadzą między sobą wielką bitwę, którą nie tak łatwo zakończyć. Tymczasem główni bohaterowie filmu, Ash i jego stworek Pikachu, wraz z Dawn i Brockiem, wyruszają po raz kolejny szukać przygód i zgubili się. Ratuje ich dziewczyna Alice, która powietrznym balonem zabiera ich do swojego miasta. Tu zacznie się ich kolejna, wielka przygoda.

Ash wraz z przyjaciółmi znajduje się w środku konfliktu pomiędzy Deoxysem a Rayquazem.